Hromatīna interakciju tīklu struktūras izpēte
Sākums: 01/2022 Noslēgums: 12/2024
-
Projekta numurs
-
lzp-2021/1-0236
-
-
Finansējums
-
299 805 EUR
-
-
Projekta vadītājs
-
Edgars Celms, e-pasts: edgars.celms@lumii.lv
-
-
Projektu īsteno
-
Latvijas Universitātes Matemātikas un informātikas institūts
-
Zinātnes nozare
- Datorzinātne un informātika
Kopsavilkums
Projekta mērķis ir izstrādāt uz tīkliem balstītu modelēšanas ietvaru, kas ir piemērots dažādu veidu genoma hromatīnu mijiedarbības datu kopu attēlošanai, efektīvu algoritmu izstrādei šādu grafu raksturīgo topoloģisko iezīmju ieguvei un analīzei, identificēto/atklāto raksturīgo pazīmju potenciālās bioloģiskās nozīmes validācijai. Projekta mērķis ir arī izpētīt saistību starp topoloģijas raksturīgajām pazīmēm un tām, kas ir atklātas hromatīna mijiedarbības datus apstrādājot ar citām analīzes metodēm, un, iespējams, izstrādāt jaunas analīzes metodes, kurās grafu reprezentācijas izmantošana var papildināt vai aizstāt šīs esošās pieejas.
Projektu konkurss:
Fundamentālo un lietišķo pētījumu projektu 2021. gada atklātais konkurss