No kukaiņu zarnu trakta mikrofloras izolētu DNS bakteriofāgu raksturošana
Sākums: 12/2020 Noslēgums: 12/2021
-
Projekta numurs
-
lzp-2020/2-0373
-
-
Finansējums
-
100 389 EUR
-
-
Projekta vadītājs
-
Andris Dišlers
-
-
Projektu īsteno
-
Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centrs
-
Zinātnes nozare
- Dabaszinātnes, Bioloģija
Kopsavilkums
Projekts veltīts oriģinālu DNS-saturošu bakteriofāgu pētniecībai, genoma un proteoma līmenī raksturojot Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centrā izdalīto DNS bakteriofāgu kolekciju. Kolekcija aptver vairāk kā 40 Caudovirales dzimtas dsDNS bakteriofāgu, kas, kopā ar to saimniekbaktērijām izdalīti no dažādu kukaiņu zarnu mikrofloras, - attiecīgie fāgu saimnieki pieder plašam G+ un G- baktēriju spektram. Projekts dos iespēju turpināt jau uzsākto BMC fāgu kolekcijas pētniecību. Anotējot fāgu genomus, īpaša uzmanība tiks pievērsta tiem hipotētiskajiem proteīniem, kas ir konservatīvi dažādu bakteriofāgu genomos. Lai gan tiek uzskatīts, ka evolucionāri konservatīvi proteīni spēlē būtisku bioloģisku lomu attiecīgos organismos, lielākajai daļai šo proteīnu funkcijas ir šobrīd nezināmas vai neskaidras. Projekta rezultāti tiks publicēti vismaz vienā rakstā atklātas pieejas žurnālā. Publiski pieejamā GenBank datubāzē tiks deponētas funkcionāli anotētas pilna genoma sekvences vismaz 10 BMC kolekcijas bakteriofāgiem.
Projekta rezultāti [PDF]
Projektu konkurss:
Fundamentālo un lietišķo pētījumu 2020. gada zinātnieku individuālo projektu konkurs